يتولى مجلس الأمناء المسؤوليات والصلاحيات التالية:

1. وضع الإستراتيجية والسياسة العامة للجامعة ومراقبة تنفيذها والإشراف على حسن سير العمل فيها بما يكفل تحقيق أهدافها.

2. دراسة إحداث كليات أو أقسام أو برامج أكاديمية أو دمجها في غيرها أو إلغائها.

3. تحديد الرسوم الجامعية في كل تخصص في الجامعة.

4.  تحديد أعداد الطلبة المقترح قبولهم سنوياً في البرامج المختلفة للكليات في مطلع كل عام دراسي وفقاً للقواعد المعتمدة من مجلس التعليم العالي.

5. إقرار الأنظمة واللوائح الداخلية لتنظيم عمل الجامعة وإدارة شؤونها.

6. الاقتراح على الوزير تسمية رئيس الجامعة ونائبه.

7. مناقشة التقرير السنوي للجامعة وميزانيتها وحساباتها الختامية ورفعها لمجلس الإدارة.

8. إقرار المنح والجوائز والمكافآت الدراسية.

9. إقرار قبول التبرعات والهبات والمنح بما لا يتعارض مع أهداف الجامعة.

10. يجوز لمجلس الأمناء تفويض بعض صلاحياته لمجلس الجامعة.

11. يجتمع مجلس الأمناء اجتماعات دورية ربع سنوية بدعوة من رئيسه، ويجتمع بصورة استثنائية بناء على طلب من ثلث الأعضاء على الأقل. ويعتبر الاجتماع قانونياً بحضور الأكثرية. وتتخذ القرارات بأكثرية أصوات الحاضرين.

أعضاء مجلس أمناء جامعة الشهباء الخاصة

​ الأستاذ الدكتور عمر إسماعيل رئيس مجلس الأمناء دكتوراه في إدارة الأعمال
​ الأستاذ الدكتور عمر وصفي عقيلي نائب رئيس مجلس الأمناء دكتوراه في إدارة الأعمال
الأستاذ الدكتور محمد اقبال المشرف رئيس الجامعة	​ د. عدنان محمد جلخي دكتوراه في الطب البشري
​ د. عامر بوشي دكتوراه في الحاسبات	​ د. عبد المهدي صالح الحمود دكتوراه في الطب البشري
​ الأستاذ ثابت الهزاع رجل أعمال	القس إبراهيم نصير إجازة في علم اللاهوت
د. عيسى علي العاكوب دكتوراه في اللغة العربية